Prima parte dell'episodio crossover che coinvolge anche "N.C.I.S. Hawaii" e "N.C.I.S.: Los Angeles". Per la prima volta le tre squadre si uniscono per risolvere un caso ad alto rischio. Un’unica indagine che si dipana lungo tre episodi, pensati nel ventesimo anno di vita della serie che racconta le avventure del Servizio investigativo della Marina militare Usa, per regalare emozioni, grande azione, situazioni inattese e colpi di scena al proprio pubblico. A Washington, sede del Naval Criminal Investigative Service, arrivano la Tennant (Vanessa Lachey) e Boone dalle Hawaii, e Callen e Hannah da Los Angeles, per partecipare alla festa di pensionamento dell’istruttore del FLETC Dale Harding, noto a tutti come “il Professore”. Purtroppo, però, la festa viene annullata, perché Harding viene trovato morto nel suo appartamento: si è suicidato sparandosi un colpo alla testa. Tutti sono increduli, ma anche sospettati, non c’era nessun motivo che potesse spingere il Professore a compiere un gesto simile. Proprio da Washington, città di azione della serie madre NCIS, e da un caso apparentemente semplice, prende l’avvio un’indagine complessa e articolata che si sviluppa in tre luoghi diversi degli Stati Uniti e che richiede l’impegno di tutte e tre le squadre per essere risolta.