Il team è alla ricerca di Ducky e Jimmy che sono scomparsi dopo aver lasciato una scena del crimine. I due sono stati rapiti da un gruppo di spie alla ricerca di qualcosa in possesso della vittima. La puntata si apre su alcuni idraulici che fanno il loro arrivo in una casa di periferia. La loro attenzione è attirata da un uomo che, seriamente ferito, barcolla per la strada, tenendosi lo stomaco. L'uomo riesce a raggiungere il furgone degli operai, per poi collassare. Poco dopo, alla sede dell'N.C.I.S., Gibbs informa la squadra. C'è stata una vittima, un ufficiale, a Richmond, circa due ore prima. Si tratta del luogotenente Gordon Roth, del settore di ricerca (assegnato a quest'incarico dopo aver riportato seri problemi all'udito in Iraq) e un esperto in decriptazione. Giunti sul poso, Palmer e Duckie caricano il corpo sul loro van. C'è in arrivo una tempesta di neve. Una persona, non vista, in un SUV nero, osserva Duckie e Palmer mentre mettono in moto. Una donna, al telefono, gli ordina di non perderli di vista. Il SUV si mette a seguire il furgone del coroner. Poco dopo, Duckie e Palmer sono costretti a fermarsi. Hanno una gomma a terra. Palmer lo trova molto strano, dato che l'ha da poco cambiata. Mentre Palmer ripara il guasto, Duckie si accorge che nella gomma c'è un proiettile. Non è stata una foratura casuale! E, infatti, i due vengono attaccati. Una donna e un uomo cercano qualcosa sul corpo di Roth. "Non è qui", afferma la donna. Per poi passare al piano b, che significa rapire Duckie e Palmer…