Bones e Booth raggiungono una scena del crimine in un area boschiva dove le autorità locali hanno scoperto alcune ossa luminescenti che temono possano essere radioattive. Prese le necessarie precauzioni, i due prima esaminano il luogo del ritrovamento, quindi vengono condotti dalla polizia in una vecchia casa di pietra dove giace un corpo decomposto. Il contatore Geiger non evidenzia alcun pericolo di radiazione, così Booth e Brennan si tolgono la maschera di protezione. Di ritorno al laboratorio, lo staff del Jeffersonian si mette al lavoro e scopre che sui resti del corpo ci sono chiari segni di numerose ferite. L'aggressore doveva essere particolarmente feroce. Grazie anche ll'aiuto del dottor Saroyan, si scopre che la vittima era Carly Victor, un giovane, quanto promettente, chef. Angela riesce a rintracciare il profilo di Carly su Myspace. Così Angela scopre che Carly lavorava in un ristorante che sia lei che Brennan frequentavano. Bone s e Booth si recano al “Carly’s Table” in cerca di ulteriori indizi. Qui incontrano Dan, il marito della vittima. L'uomo pare all'oscuro di tutto e sostiene di aver visto Carly il venerdì precedente, poco prima che andasse con l'amica Abby a fare un versamento degli incassi settimanali...