Nella baia di Chesapeake, vengono ritrovati i resti del cadavere di una donna, e Brennan e Booth si recano sul posto per indagare. Il team ha ben poco su cui poter lavorare: soltanto il torso della vittima. Gli indizi portano i due in una piccola cittadina del Maryland, dove la donna uccisa lavorava come pastore di anime. Nel frattempo, viene ritrovato il resto del cadavere, e Brennan e Booth si rendono conto che devono riesaminare le loro teorie sul caso...