Brennan e Booth raggiungono la tomba del soldato Charlie Kent. Proprio nel giorno dell'anniversario della sua morte (è passato un anno) vicino al luogo di sepoltura è stato trovato un corpo completamente carbonizzato. Charlie è rimasto ucciso nel corso di un'operazione in Iraq. Fatto che mette Booth di fronte ai fantasmi del passato. Di ritorno al Jeffersonian la squadra si mette subito al lavoro per l'identificazione. Angela scopre che si tratta di Devon Marshall, compagno di Kent in Iraq. Brennan è convinta che Devon non si sia suicidato. Crede sia stato ucciso e poi messo sulla tomba di Charlie per farlo sembrare un suicidio di protesta. Booth e Bones si recano a far visita alla madre e alla sorella di Devon nella speranza di scoprire qualcosa che possa portarli sulla pista giusta. Le due donne fanno il nome di Jimmy Merton, anch'egli ex soldato...