La squadra del Jeffersonian indaga sulla morte di un esperto di scene del crimine i cui resti sono stati rinvenuti in un involucro misterioso e impenetrabile portato a riva dalla marea. In laboratorio Hodgins, grazie al laser, riesce ad aprire l'involucro, sebbene gli costi uno svenimento. Non il massimo per il "re del laboratorio". Il teschio della vittima è privo di alcuni denti, alcune ferite trovate sul corpo mostrano il marchio di un noto negozio fai da te. Booth e Bones si recano immediatamente sul posto per mostrare l'immagine ottenuta da Angela grazie alla ricostruzione facciale. "Oh mio Dio, Lucky è morto?" questa la reazione di Renee, una delle impiegate. A quanto pare Lucky era un cliente affezionato, forse perché aveva una relazione con la ragazza. Lucky era anche sposato e i nostri si recano dalla moglie Lisa. La donna non sembra sorpresa del tradimento, né particolarmente scossa per la perdita della dolce metà. Inaspettatamente, Bones, seguendo la sua intuizione, condurrà le indagini seguendo un rituale di "pseudomagia" appreso a El Salvador. Nel frattempo Angela ed Hodgins scoprono che Cam sta segretamente portando avanti una relazione amorosa con Vaziri.