In una botte presso l’azienda vinicola Bedford Creek viene ritrovato il corpo di un critico di vini. Si scopre che un rivale della Bedford Creek ne falsificava le bottiglie e ha ucciso il critico per non farlo parlare. Intanto, Brennan annuncia di volere un figlio e convince Booth a donarle il suo sperma. Booth ha sentimenti ambivalenti a riguardo, perché vorrebbe essere coinvolto come padre; intanto, continua ad essere colto da allucinazioni. Brennan lo convince ad andare in ospedale, dove gli viene diagnosticato un tumore benigno al cervello, che urge un immediato intervento chirurgico...