Episodio conclusivo dell'undicesima stagione della serie. La puntata è un omaggio all'attore Ralph Waite, che in più di una occasione ha interpretato il padre di Gibbs, Jackson Gibbs, e che è venuto a mancare il 13 febbraio del 2014 all'età di 85 anni. In una storyline che ricalca la realtà, Gibbs riceve la triste notizia della morte del genitore, stroncato da un infarto. La squadra, intanto, si trova a indagare su un caso molto complesso. C'è stato un incendio, in apparenza del tutto accidentale, sulla USS Niagara. Si tratta, appunto, solo di apparenza. Nel caso è coinvolta la CIA. Sandra Jenkins e il Capitano Arnold Craig informano Vance e la squadra che a bordo della nave è stato portato un congegno incendiario. La nave, infatti, era una sorta di prigione per un nutrito gruppo di terroristi, catturati in seguito all'arresto di Benham Parsa. Due di loro sono fuggiti. Con ogni probabilità l'incendio è stato abilmente sfruttato come un diversivo.