Si conclude la tredicesima stagione della longeva serie. La puntata segna l'addio al cast di Michael Weatherly, lo storico interprete di Tony DiNozzo. Dopo aver scoperto che il responsabile degli omicidi non è Jacob Scott, bensì Trent Kort, l'NCIS, l'FBI e l'MI6 uniscono le loro risorse in una task force internazionale per stanare la spia. Alcuni indizi farebbero supporre che Kort si sia recato in Israele per far scomparire i file di Eli David che lo incastrano. Il che potrebbe mettere in pericolo anche Ziva. Tony prega Gibbs di mandarlo in missione e Gibbs accetta. Monroe, al contrario, crede che Kort sia ancora nel Paese. Durante le indagini, Tony riceverà una notizia che lo sconvolgerà profondamente, portandolo a prendere una decisione inaspettata che lo condurrà lontano dalla squadra.