Episodio crossover con la serie spinoff "N.C.I.S. New Orleans". Il controllo volo non riesce a mettersi in contatto con un aereo privato. Il pilota non risponde. Gibbs e la squadra vengono preallertati: se la situazione dovesse persistere dovranno abbatterlo. Ben presto si scopre che, a bordo, sono tutti morti. Gibbs chiede ad Abby e McGee di escogitare un piano per far atterrare l'aereo in una zona non abitata. Il volo proveniva da New Orleans, così Gibbs si mette in contatto con Pride per fargli fare alcune verifiche. Purtroppo non ci sono buone notizie. Pride scopre che imbarcato c'era anche il fratello di Abby. L'informazione, però, non viene confermata. Una volta che l'aereo è stato fatto atterrare, infatti, Abby immediatamente controlla, ma suo fratello non risulta tra le vittime, tutte uccise da una tossina. L'uomo deve per forza essere ancora a New Orleans. L'aereo appartiene a un milionario. Sul volo c'era anche un comandante della Marina in procinto di incontrarsi con il Segretario della Difesa...