L'NCIS è chiamato a indagare sull'omicidio di un sergente dei marines. Ben presto si scopre che la vittima è una donna che aveva assunto l'identità di un soldato deceduto. Ma il volto e le mani della vittima sono state bruciate con l'acido e la squadra ha difficoltà a identificarla. Grazie a un dettaglio, un'iscrizione sulla collana che la vittima indossa, si scopre almeno il nome della donna: Nadira. La collana si dimostra ancor più preziosa quando su di essa si rileva un'impronta digitale che porta la squadra dritto verso il sospettato: un sicario ingaggiato per portare a termine "un delitto d'onore". Gibbs scopre che l'uomo stava lavorando a una lista di nuove identità da dare a delle donne afghane giunte illegalmente negli Usa. Queste si trovano in rifugio segreto collegato a Mike Frank. La situazione precipita quando giunge notizia di un imminente attacco contro il rifugio...