Dopo due anni che la Mistery Inc. ha chiuso l'attività, i suoi componenti, Scooby- Doo, Fred (Freddie Prinze Jr.), Daphne (Sarah Michelle Gellar), Shaggy (Matthew Lillard) e Velma (Linda Cardellini) vengono chiamati a Spooky Island per indagare su alcuni "strani" avvenimenti. Il proprietario del luna-park, infatti, è convinto che il luogo sia infestato da fantasmi. Dimenticato il passato, toccherà ancora una volta alla banda risolvere il caso…

CURIOSITA' - Sarah Michelle Gellar ha girato il film, alternandolo alle riprese di "Buffy, l'ammazzavampiri" (che stava registrando in contemporanea). Questo l'ha costretta anche a girare due settimane a Los Angeles, Buffy, e poi andare le due settimane seguenti a Queensland, in Australia, per le riprese di Scooby-Doo. A proposito di ciò, in un episodio della stessa serie, Buffy e i suoi amici sono occasionalmente chiamati "La Scooby-gang". Le scene girate in Australia sono state effettuate alla Bond University, nella costa d'oro, famosa per avere condizioni meteo ottime per quasi tutto l'anno. Durante le riprese, però, Linda Cardellini si è ammalata (influenza) e ciò ha costretto la produzione ad uno stop di alcuni giorni. In una scena del film, quando Daphne, Shaggy e Scooby entrano nel castello, Shaggy chiama Scooby "La furia di Honk Kong"; il riferimento è ad un altro cartone di Hannah