Puntata conclusiva della sesta stagione. Dopo la morte dell'agente del Mossad Rivkin, Ziva si reca in Israele con Vance, Gibbs e Tony. Qui riferiscono al direttore del Mossad la loro versione della storia. Le complicazioni aumentano, così Gibbs è costretto a prendere una difficile decisione. Ziva, non riuscendo ad accettare che DiNozzo abbia ucciso Rivkin, chiede a Gibbs di scegliere tra lei e Tony.