L'episodio si apre con Gibbs, su una spiaggia messicana, che scopre il corpo di un uomo, a faccia in giù, immerso nella sabbia. La scena si sposta a tre giorni dopo. La squadra indaga sull'omicidio dell'agente speciale Lara Macy, il cui cadavere presenta gravi ustioni. Prima di morire Lara stava investigando sullo stupro di Kaylen Burrows il che lascia supporre che lo stupratore potrebbe anche essere il killer. Le prove portano a Tyler Hammond, studente di college che si trovava nello stesso bar dove si trovava la Burrows la sera dell'aggressione. Ulteriori indagini portano a sospettare il coinvolgimento anche di Randall Hammond, padre di Tyler, nonché magnate dell'edilizia. Dalle analisi di Ducky, però, si evince che la lama con la quale è stata tagliata la gola di Kaylen apparteneva senza dubbio a un coltello di precisione che è stato maneggiato da qualcuno che sapeva perfettamente come utilizzarlo. Gibbs capisce che l'omicida non ha nulla a che fare con lo stupro sul quale Macy stava indagando. Nel frattempo, Abby è tormentata dalla verità che ha scoperto sul conto di Jethro e non sa come agire in merito...