Numerose casse contententi M16 sono state rubate. Un ufficiale della Marina ci ha rimesso la vita, un altro, ferito, viene ricoverato nell'ospedale dove lavora il dottor Dr. Cyril Taft (Jon Cryer). Insieme a lui l'ambulanza porta anche uno degli aggressori. Gibbs, giunto al pronto soccorso, dice a Taft di aver assoluta necessità di interrogare il criminale. "Non farlo morire!" tuona. Nonostante i tentativi del dottore, però, l'uomo non ce la fa. In seguito al decesso, Cyril si reca immediatamente da Ducky per informarlo di un particolare alquanto inusuale. Il deceduto aveva un impianto nel braccio. Abby lo analizza e scopre che l'impianto, originariamente creato per un femore, apparteneva a Padre Gerard Carlin, un prete cattolico di Dallas scomparso in Sudan anni prima. Il caso porterà Tony a ritrovare Jeanne Benoit (Scottie Thompson).