In ufficio arriva una lettera sigillata con un bacio indirizzata a Tony, che, senza sospettare nulla, la apre e trova all'interno una strana polvere. Subito scatta l'allarme nella sede del NCIS e Tony viene messo in quarantena insieme a Kate, anche lei presente al momento dell'apertura della busta. Mentre Gibbs e McGee indagano sul mittente della lettera, Tony inizia a stare male...