Al via la sesta stagione della serie. La puntata di apertura si riallaccia al finale della quinta. Avevamo lasciato Sam e Callen intrappolati in un sottomarino governato da tre islamici decisi a farlo esplodere contro la portaerei americana USS Van Buren. Una situazione praticamente senza via d'uscita. Ma se c'è qualcuno in grado di superare anche l'impossibile, di certo si tratta di Sam e Callen. Per scongiurare il disastro, a Sam non resta che affondare il sottomarino, prima che raggiunga l’obiettivo. Intanto Kensi e Deeks si danno da fare per salvarli e riescono a farsi dare da Granger un elicottero da cui assistono all’emersione dei colleghi che se la cavano con una nuotata non prevista! Tutto bene quel che finisce bene, dunque. La puntata si conclude con grandi festeggiamenti in un clima di ilarità. Ma per Hetty le grane non sono finite. La donna mette in guardia Granger, la cosa migliore da fare è raccontare a quelli di Washington la verità. Cosa farà Granger, seguirà il consiglio?