Una squadra di agenti federali sta trasportando Jada Khaled, l'importante testimone che Sam ha portato in America dal Sudan. Ma, nonostante tutte le precauzioni, il team cade in un'imboscata. Callen e Samuel arrivano sul posto. Grazie alle telecamere di sorveglianza i due possono visionare il video che ha immortalato l'imboscata. Per Sam è difficile lavorare al caso perché deve affrontare nuovamente Jada e quello che c'è stato tra di loro. Inizialmente Hetty decide di esonerare Sam dal caso. Ma, inutile dirlo, Sam è di ben altro avviso. La situazione si complica quando alcune circostanze portano a pensare che nell'imboscata possa essere coinvolto anche Khalid, il fratello di Jada...