Di Kensi non ci sono più tracce. Temendo che possa essere caduta in mano ai Talebani, Hetty organizza immediatamete una missione di salvataggio. Si parte alla volta dell'Afghanistan. La chiamata per la squadra arriva nel cuore della notte. Prima che i suoi uomini entrino in azione, Hetty dice a Sam di tenere d'occhio Deeks. Se i suoi sentimenti per Kensi dovessero rivelerasi d'intralcio alla missione, dovranno lasciarlo da parte. Ed è esattamente quello che Sam fa, incaricando l'amico e collega di ottenere informazioni da un chierico musulmano. Così, mentre Deeks si trova a dover affrontare i suoi demoni (torturare o meno il suo prigioniero per cercare di salvare la donna che ama?), Sam, Callen e Granger rintracciano la grotta dove Kensi e Jake sono stati tenuti prigionieri. Dentro solo sangue e un computer con foto di entrambi morti, le loro gole squarciate. Callen si rifiuta di crederci e decide di continuare le ricerche. I fatti gli daranno ragione? Kensi e Jack sono ancora vivi? Nel corso dell'episodio molte domande troveranno risposta.