La Mosley deve sottoporsi ad un'inchiesta gestita dal vicedirettore Ochoa e dal procuratore speciale Rogers, riguardo all'operazione non autorizzata in Messico con cui la squadra ha liberato il figlio della Mosley, Derrik. Nella sede dell'NCIS c'è l'ammiraglio Kilbride, dal momento che Hetty continua a essere latitante. Intanto viene alla luce l'esistenza di una "lista nera" di un cartello della droga...