Il corpo del sergente Ellie Sims viene trovato carbonizzato in mezzo alla campagna. La donna, crittografa della Marina, aveva scoperto dei messaggi in codice di militanti dell'ISIS provenienti dalla Siria e diretti negli Stati Uniti, ma dei suoi rapporti non c'è traccia. Avviate le indagini dell'NCIS, il suo supervisore, il sergente Michael Baird, muore in un'esplosione che lui stesso ha provocato...