La squadra dell'NCIS si ritrova a dover risolvere il mistero che riguarda la morte del Sottotenente Grant della Marina Militare. La portaerei sulla quale era in servizio viene messa in quarantena per sospetta epidemia di ebola, cui cui inizialmente viene attribuita alla sua morte, ma attraverso le indagini i risvolti saranno diversi. Intanto, Kensi è particolarmente preoccupata: sospetta di essere incinta e ha paura che lavorando a questo caso possa contrarre la malattia...