Una giornata di guerra per la squadra. La talpa ha fatto la sua nuova mossa col risultato che Granger, Deeks, Sam e Callen vengono arrestati, da diverse Agenzie, tutti nello stesso giorno, quello in cui il sottosegretario Corbin Duggan fa il suo arrivo per accogliere le dimissioni di Hetty. Ma non tutto è perduto. Kensi, Eric e Nell riescono per un soffio a sfuggire a un'irruzione dell'FBI...