Prima parte del season final di questa quinta stagione. Tony e Ziva vengono assegnati a una nuova missione. Devono scortare la direttrice Shepard a Los Angeles dove avranno luogo i funerali dell'agente speciale William Decker, ufficiale ormai in pensione dell'NCIS. Secondo l'autopsia Decker si sarebbe tolto la vita. Ma, durante la cerimonia, Jenny nota che un uomo misterioso chiede di un certo signor Oshimaida. Tanto basta per convincere la donna che Decker, in realtà, è stato assassinato. Oshimaida, infatti, era una parola in codice che lei e William avrebbero dovuto usare durante una missione che li vide impegnati in Europa anni prima e che avrebbe significato che la loro copertura era saltata. Non sapendo a chi altri rivolgersi, Jenny chiede aiuto Mike Franks, giunto dal Messico per presenziare alla cerimonia. Per poter lavorare sul caso in segreto, Jenny dà la serata libera a Tony e Ziva. Ma il divertimento per i due sarà di breve durata. Ben presto, infatti, la macchina della direttrice viene ritrovata abbandonata vicino a una scena di un omicidio. Tony e Ziva chiedono l'aiuto di McGee e Abby. I quattro si mettono febbrilmente al lavoro nel tentativo di trovare Jenny prima che Gibbs venga a sapere della sua scomparsa...