La guerra con New York continua. Carmela (Edie Falco) e i ragazzi si trasferiscono in una casa sicura e anche Tony (James Gandolfini) sta nascosto con gli altri della Famiglia. Si ritrovano tutti solo per il funerale di Bobby Bacala, dal momento che la sorveglianza dell’FBI mette al riparo da brutte sorprese. Sempre grazie all’FBI, o meglio all’agente Harris, Tony riceve una vaga indicazione su dove trovare Phil Leotardo. A questo punto chiede a George di organizzare un incontro con Little Carmine e Butch. All’incontro viene raggiunta un’intesa fra New York e New Jersey con il via libera a Tony per l’eliminazione di Phil che, poco dopo viene ucciso. Mentre si cominciano a organizzare le nozze fra Meadow (Jamie-Lynn DiScala) e Patrick, Anthony (Robert Iler) comunica al padre la sua intenzione di arruolarsi nell’esercito. Tony offre a Paulie di prendere il comando della squadra che era di Ralph Cifaretto. Paulie vorrebbe rifiutare: è convinto che su quell’incarico gravi un malocchio, ma poi accetta quando Tony ventila l’idea di offrirlo a Patsy Parisi. Carlo Gervasi è sparito, e Mink riferisce a Tony che si è venduto: testimonierà al gran giurì. Tony e chissà chi altri rischiano varie incriminazioni...