­McGarrett e la squadra devono ritrovare e portare al sicuro una testimone di un processo per omicidio. La squadra di agenti che era stata mandata a prenderla è stata massacrata e la donna, al momento, si trova nella giungla, braccata dagli assassini che vogliono metterla a tacere per sempre. McGarrett e Chin Ho riescono a trovarla in tempo e mentre Chin Ho la porta al quartier generale, McGarrett si mette sulle tracce dei delinquenti. Nel frattempo, Danny deve dare una mano a Rachel. La sua auto è stata rubata e il suo appartamento messo a soqquadro...