In seguito all'omicidio del figlio di un giudice, rimasto ucciso in un'esplosione, la squadra comincia a indagare su un attentatore che potrebbe covare astio contro il sistema giudiziario. Una seconda bomba uccide il figlio di un procuratore distrettuale. Chin Ho riesce, attraverso un frammento dell'ordigno, a risalire a un negozio che potrebbe aver fornito materiale al killer. Insieme a Kono, Chin Ho scopre anche alcuni indizi che riconducono a Marshall Roan, il cui figlio è morto di recente in prigione. Nel frattempo, Danny scopre che suo fratello Matt, broker a Wall Street, non si trova alle Hawaii per una cordiali visita. Matt è al centro di un'indagine federale...