Jones si fa catturare dalla Divisione Fringe sapendo di avere piu' di un asso nella manica per farsi rilasciare, compreso l'appoggio del Colonnello Broyles. L'unica variabile che non aveva previsto e' la presenza di Peter, che, avendolo fermato una volta, spera di poterlo fare di nuovo. I due universi sono adesso relamente coalizzati contro un nemico comune. Jones ha infatti estratto un minerale che gli consente di spostarsi indisturbato tra i due mondi.