Un uomo d'affari muore espellendo un getto di sangue infetto da un virus letale. Olivia e Peter, chiamati ad investigare, si ritrovano rinchiusi in quarantena all'interno dell'edificio, insieme agli altri impiegati. Si scopre che l'uomo, un consulente petrolifero, aveva maneggiato un campione di carotaggio di una perforazione esplorativa petrolifera, infetto dal virus. Walter scopre che le persone infette tentano di diffondere il virus prima di morire. Data la pericolosità del virus il centro di controllo delle malattie decide di uccidere tutte le persone presenti nell'edificio per evitare la diffusione. Walter, tuttavia, riesce a trovare una cura, salvando gli impiegati, Olivia e Peter. Mentre Walter sta lavorando alla cura, rivela ad Astrid che "non può lasciare che Peter muoia ancora". Alla fine dell'episodio Astrid chiede spiegazioni al dr.Bishop riguardo la frase, ma quest'ultimo le risponde che "alcune cose devono essere lasciate nascoste".