Durante una indagine, Sherlock ha un vuoto di memoria di sei ore e finisce per ritrovarsi a casa, con una borsa contenente una testa umana. Messo spalle al muro, Holmes è costretto a dire la verità sulla sua malattia al capitano, il quale lo costringe a sottoporsi ad una serie di controlli medici e lo sospende temporaneamente dal lavoro. Nel frattempo, Joan e Marcus continuano ad indagare sul caso, ma ogni volta che arrivano in un posto scoprono che Sherlock c'è già stato...