Nel quartiere di Little Italy, durante la tradizionale festa di San Gennaro, un uomo viene colto da malore: cade a terra, tra la folla, e muore. L'uomo, Greg Thompson, presenta dei segni che fanno pensare che sia stato vittima di un pestaggio. Il caso si complica quando arrivano gli esiti dell'autopsia che rivelano che i segni delle percosse sono post-mortem: l'uomo è stato ucciso da una scheggia di legno conficcata nel cuore. Intanto Mac viene chiamato a Central Park, dove trova Lindsay alle prese con il cadavere di Jared Stanton, un uomo d'affari, trovato seduto su una panchina con la testa decapitata. Hawkes si occupa della morte di un ragazzino di dieci anni, genio degli scacchi, avvenuta a seguito di un incendio che presenta alcuni elementi sospetti.