In seguito alla morte del suo mentore, un artificiere rimasto ucciso mentre disinnescava una bomba, Horatio Caine (David Caruso) intraprende un'indagine per scoprire chi sia il dinamitardo assassino. Vista la determinazione di Horatio, Megan (Kim Dealney) inizia a chiedersi se il collega non sia troppo convolto a livello emotivo. Dopo aver setacciato meticolosamente l'area interessata dall'esplosione dell'ordigno, però, molti quesiti rimangono ancora senza risposta. Chiamati a indagare su un altro attentato dinamitardo, Megan e Horatio scoprono che questo è correlato col precedente e che chi ha messo la bomba in entrambi i casi voleva colpire gli artificieri...