Un uomo viene legato, picchiato, mutilato e infine ucciso nel suo negozio. Le ferite rivelano che l'assassino ha utilizzato lo stesso attrezzo tagliente che la vittima usava per la sua attività di fabbricazione dei sigari. Horatio indaga nell'ambiente degli immigrati cubani scoprendo che la vittima ha un passato da torturatore. Intanto Tim e Calleigh si occupano dell'omicidio di un uomo avvenuto mentre la vittima si trovava ad uno sportello bancomat. La presenza del denaro sulla scena del crimine esclude la rapina come movente dell'uccisione.