E' il giorno delle nozze di Cam e Arastoo, ma tra balli, brindisi e auguri, si intrecciano anche alcuni drammi personali dei protagonisti della serie. Hodgins e Angela aspettano un secondo bambino, e sono in trepidante attesa di sapere se il bimbo abbia contratto la malattia genetica di cui i genitori sono portatori. Aubrey non sa se e come chiedere a Jessica di trasferirsi con lui a Los Angeles. Inoltre, la mattina successiva, ci sara' l'udienza di Zack, a cui Brennan e Hodgins dovranno partecipare, la prima in qualita' di sostenitrice dell'amico e collega, il secondo come testimone della difesa. Il giorno successivo Kovac, l'uomo che ha ucciso Max e minacciato tutta la sua famiglia, evade dalla prigione e si prepara a far saltare in aria il Jeffersonian. Booth riesce a intuire il piano del criminale e a far evacuare l'edificio quasi interamente, ma lui, Brennan, Angela e Hodgins restano intrappolati all'interno...