Episodio d'apertura della terza stagione. Tre ragazzi percorrono in auto una strada quando, all'improvviso, un oggetto si schianta contro il parabrezza infrangendolo e dando il via a un tamponamento a catena. Quando Booth arriva al Jeffersonian, Bones e Cam stanno facendo un colloquio a Clark Edison, candidato al posto lasciato libero da Zack. Booth insiste affinché Bones lo segua sul luogo dell'incidente, ma lei non sembra averne davvero voglia, fatto che infastidisce il detective. L'atteggiamento dell'antropologa cambia quando, sul luogo del tamponamento, rinviene un teschio umano. Nel frattempo, Angela e Hodgins si incontrano con Doug Doyley, un detective privato. I due stanno cercando di rintracciare l'ex di Angela per ottenere il divorzio. Ma Angela, incredibilmente, non sembra nemmeno ricordarsi il nome dell'uomo. Sa solo che è alto, con un fisico possente e nero. Ritornati al laboratorio, Brennan inizia le indagini sul teschio. Cam irrompe manifestando tutto il suo disappunto per il fatto che Temperance non riesca a trovare un nuovo assistente. Ma Bones ha altro per la testa, deve chiamare immediatamente Booth, il teschio ha uno strano segno...