Brennan e Booth vengono chiamati in un sobborgo di Washington, abitato perlopiù da immigrati di origine latina, in seguito all'arresto di un certo José Vargas. L'uomo, un membro di una banda nota come Mara Muerte, è stato beccato con i resti di un corpo di donna nel bagagliaio. Mentre Brennan cerca, infruttuosamente, di ottenere qualche informazione da Vargas, un'auto nera soppraggiunge a tutta velocità sparando sulla polizia. Vargas approfitta della confusione per darsela a gambe. Lasciando Booth con un pugno di mosche. Più tardi, al laboratorio, Zack, Hodgins, Angela e Temperance iniziano ad esaminare le ossa che si trovavano nel bagagliaio di Vargas. Dai primi risultati si suppone che il corpo sia stato seppellito almeno per sei mesi. L'esame dell'arcata dentale denota una malnutrizione. Viene confermata la provenienza della donna dal Centro-America. Ma l'identificazione sembra quasi impossibile. Temperance chiama in causa anche Goodman per fargli analizzare il rosario che la donna teneva con sè. Poi Zack fa un'ulteriore scoperta: sul cranio della vittima c'è una profonda depression. L'arma del delitto potrebbe essere una mazza da baseball...