In un vecchio cimitero riaffiorano i resti di persone sepolte e tra queste ci sono i resti di un corpo sepolto solo tre anni prima, e senza bara. E’ subito evidente che l’uomo è stato ucciso e passo dopo passo si arriva anche a scoprire che si tratta di un prete che aveva lasciato di punto in bianco la parrocchia tre anni prima. Le piste che i nostri amici seguono sono molte ma Booth è convinto che il responsabile dell’omicidio sia padre Donlan, un vecchio parroco molto severo e poco aperto alle innovazioni. Solo alla fine, ricomponendo tutti i tasselli del puzzle, Booth (David Boreanaz) si renderà conto che ad uccidere è stata un’altra persona.