Sara (Ambra Angiolini), impegnata nel caso più difficile che abbia mai affrontato, fatica a dividersi tra lavoro e vita personale: Marina si è trasferita da lei a Roma ed è sempre più ribelle e difficile da gestire. Ginevra, che si trova con Victor sul campo dell'emergenza, collaborando al suo fianco inizia a sospettare che Victor stia nascondendo qualcosa, poiché sembra diverso dal solito e particolarmente preoccupato. Quando Renato propone a Sara di andare a vivere insieme, Sara decide che è il momento di presentare la figlia al suo compagno. Tuttavia, prima dell'appuntamento, Renato fa una scoperta inquietante sulla propria salute e scompare senza dare spiegazioni. Nel frattempo, il biologo marino Merlo viene spronato dal suo assistente Ahbed a continuare le indagini sulle misteriose navi affondate.