Dopo una forte tempesta la Hammersley si imbatte in un catamarano, ma non c'è nessuna traccia dell'equipaggio. L'imbarcazione è registrata a nome di un uomo salpato tre giorni prima, Flynn vuole approfondire le ricerche anche se Kate e una parte dei marinai pensano sia inutile. Emerge inoltre che una folta squadra di federali sta svolgendo ricerche sull'isola di Bright, ma né gli agenti nè il comando della marina rivelano cosa stia accadendo.