Callen si trova sotto custodia all'ATF. Sam viene trattenuto dalla DEA, Deeks è stato arrestato dall'agente Whiting e Granger, ferito in prigione, viene trasferito in ospedale. Cari Brown fugge dal carcere ed è latitante. La squadra è decimata ed Hetty, prima di allontanarsi, dà ordine di mandare gli impiegati a casa per farli stare al sicuro. La situazione, già di per sé molto complicata, peggiora ulteriormente quando Kensi viene rapita da un uomo di cui era certa potersi fidare...