Episodio d'apertura della quinta stagione della serie. Riprendiamo esattamente da dove avevamo lasciato. Mentre Deeks e Sam vengono torturati senza pietà, Sidorov riesce a stringere un patto con Javier per piazzare le armi nucleari. La squadra dell'N.C.I.S. scopre che le armi si trovano a bordo di un natante. Purtroppo Janvier, dopo lo scambio, riesce a scappare. Fortunatamente Deeks e Sam vengono tratti in salvo e portati in ospedale. Sam non ci resterà molto. Michelle è con Sidorov e lui farà di tutto per salvarla. Dopo una folle corsa contro il tempo, gli agenti giungono alla resa dei conti. Riusciranno ad arrestare i due criminali? Che ne sarà di Michelle?