Si riapre un vecchio caso che vede coinvolti i coniugi Keith e Lynn Stiger, amici del tenente Naomi Elder, uccisa da un cecchino mentre si allenava in piscina. Ora si sospetta che lo stesso Keith abbia a che fare con l'omicidio e l'ipotesi è avvalorata dalla sua improvvisa scomparsa e dal ritrovamento del cadavere della moglie Lynn. Grazie all'aiuto di Jennifer Kim (Malese Jow), ex spia nordcoreana, nonché figlia di Granger, si scopre che anche Keith è una spia. Nel frattempo, mentre Hetty cerca di ritrovare il suo equilibrio, Callen e Sam vengono a sapere che Granger è morto...