Tom Norris (Aiden Turner), amministratore delegato di un'industria che lavora nel campo delle biotecnologie, salta in aria con la sua splendida Ferrari in quello che, da subito, mostra tutti gli aspetti del classico attentato. Rimangono due domande cui dare risposta: chi l'ha fatto fuori e perché? Il fatto che sia stata utilizzata una bomba incendiaria al fosforo porta la squadra sulle tracce della Omni, un gruppo legato non solo a una spedizione di fosforo (guarda caso), ma anche tra i maggiori investitori della Norris BioTech (seconda "coincidenza"). Si scopre che tutto ruota attorno alla creazione di un vaccino top secret che interessa molto anche al Governo degli Stati Uniti. Nel frattempo Deeks, sebbene rientrato in squadra, dimostra di non aver ancora superato il trauma delle torture subite. Riuscirà a riprendersi completamente?