Durante una rapina in banca, fortunatamente senza feriti, viene rubata una sola cassetta di sicurezza, appartenente ad una società di consulenza corrotta. La squadra dell'NCIS comincia ad investigare sulla società e scopre che le cose non sono semplici come si credeva: c'è di mezzo un gioco di spionaggio e di controspionaggio. Intanto Deeks sta ultimando con entusiasmo i lavori al suo bar e Kensi cerca di assecondarlo.