Episodio conclusivo della prima stagione della serie. McGarrett non fa a tempo a ricevere i complimenti dalla Governatrice Pat Jameson per gli ottimi risultati ottenuti nella riduzione del crimine, che la macchina della donna esplode, uccidendo Laura Hills, una sua assistente. La squadra entra subito in azione e scopre che, con ogni probabilità, dietro l'attentato c'è Wo Fat. Nel corso delle indagini, McGarrett scopre anche qualcosa di inaspettato: a quando pare la Jameson nasconde nel suo ufficio alcuni oggetti mancanti dalla scatola degli attrezzi di suo padre. E non è finita. Con ogni probabilità la donna è in qualche modo collegata proprio a Wo Fat. McGarrett non perde tempo e chiede ai suoi di lavorare su questi nuovi indizi. Ma, ben presto, la squadra si trova ad affrontare eventi inattesi: a Chin Ho viene offerto un nuovo lavoro, McGarrett si ritrova a essere un latitante con a carico un'accusa di omicizio e Kono viene arrestato per il furto di 10 milioni...