­McGarrett, la squadra e l'analista della CIA Jenna Kaye si preparano a entrare in una casa che credono sia usata da Wo Fat come covo. All'interno vi trovano Sang Min che riesce a scappare. I nostri lo inseguono, nella caccia Danny entra in un'abitazione e vi trova un corpo. Danny non fa a tempo a controllare il polso che viene colto da violente convulsioni. Jenna Kaye non ha dubbi: sia Danny che l'altra vittima sono stati esposti a una neurotossina che, in seguito, si scoprirà essere il Sarin. Mentre il poliziotto si trova in convalescenza, ­McGarrett e gli altri cominciano a indagare sul morto. A quanto pare si tratta di un senza tetto...