Tony Axelrod (Andrew Borba), dell'NSA, chiede a Hotch aiuto per indagare sulla scomparsa di tre agenti della DEA che si trovavano a El Paso nell'ambito di una collaborazione tra le due agenzie allo scopo di smantellare un cartello della droga. Purtroppo, uno dei tre agenti viene trovato cadavere. Con un particolare raccapricciante: sul suo volto è stato messa la pelle del viso di una seconda vittima, al momento non ancora identificata. Axelrod è convinto che i tre operativi siano stati incastrati da una talpa e sospetta di Bernard Graff (Rick Ravanello), l'assistente del Direttore dell'NSA Brian Cochran (Tom Everett). Tony vuole a tutti i costi mantenere il segreto sull'indagine e chiede a Hotch assoluto riserbo. L'unico altro membro della squadra a conoscenza del caso è Rossi, mentre gli altri profiler crederanno di essere sulla pista dell'ormai famigerata "Sporca Dozzina".