Castle e Beckett si svegliano insieme. Sono su un materasso e per giunta ammanettati! Ma non hanno certo trascorso una notte di passione. Al contrario. I due si trovano in un oscuro sotterraneo. Tutti i loro affetti personali sono stati portati via. Un piccolo segno sulla schiena di Beckett suggerisce che i due siano stati drogati. L'ultima cosa che si ricordano è di essersi incontrati per lavorare a un nuovo caso. Torniamo un po' indietro nel tempo. Alla vittima di un omicidio sono state cancellate le impronte digitali per impedirne il riconoscimento. Lanie trova in una tasca dello sconosciuto un pezzo di carta con un indirizzo. Sfruttando l'indizio, Castle e Beckett si ritrovano in una casa abbandonata dove trovano un'anziana signora in una gabbia. Poi il buio...