Al parco divertimenti Funhose due giovani vengono uccisi e in seguito travestiti da clown. Folsom (Matt Lauria) e Allie seguono il caso e cominciano a seguire una pista che li porta a chilometri dal luogo del delitto. Intanto nella sede del CSI, il caso David Hodges raggiunge una svolta. Grissom e Sara analizzano la composizione del luminol ritrovato nell'appartamento di Kline e si avvicinano finalmente alla verità...